甲藻主要繁殖方法是细胞分裂，每个子细胞各为母细胞的一半，另外的一半由子细胞自己发育；或是在母细胞体内产生2个或偶为多个能运动的游动孢子，或不能运动的不动孢子；此外，休眠型的芽胞也有发现。有性生殖仅在少数属种中发现。那么甲藻是赤潮的一种吗？
生物灾害安全小知识：
甲藻又称“双鞭甲藻”，是一类单细胞具有双鞭毛的集合群。形状有球状、丝状不定形和变形虫状等。甲藻的细胞壁由纤维素组成，细胞含有叶绿素a和c，叶黄质和β-胡萝卜素。甲藻的运动细胞有两条顶生或侧生鞭毛，其中一条是茸鞭型，另一条是尾鞭型。而赤潮是一种复杂的生态异常现象，发生的原因也比较复杂。关于赤潮成因尚没有定论，科学家们认为，赤潮是近岸海水受到有机物污染所致。在正常的情况下，海洋中的营养盐含量较低，这就限制了浮游植物的生长（有些鞭毛虫类（或者甲藻类）还是一些鱼虾的食物）。但是，当含有大量营养物质的生活污水、工业废水(主要是食品、造纸和印染工业)和农业废水流入海洋后，再加上海区的其他理化因素有利于生物的生长和繁殖时，赤潮生物便会急剧繁殖起来，便形成赤潮。因此甲藻不是赤潮的一种。
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