第一，用户打开移动硬盘的时候，发现里面的文件夹和文件很多都不见了，或者部分找不到了，而在查看移动硬盘内存的时候，发现去占用了一定的空间，这是因为移动硬盘被侵入了病毒，然后隐藏了文件或者文件夹所致。
第二，虽然移动硬盘中的文件和文件夹都在，但是查看它的属性，用户就会发现，本来几百兆的文件夹变成了几KB，这主要是因为文件或文件夹被隐藏的同时自动生成了快捷方式。
第三，用户进入移动硬盘的速度极慢，双击进入时总是显示被某某程序占用之类的提示，或者会出现“自动播放”、“Auto”等字样，这些都是移动硬盘被侵入病毒的具体表现。
第四，用户在使用的时候，突然无法进入移动硬盘的某个分区，例如无法进入C盘或者D盘，这时用户就要当心了，有可能移动硬盘被病毒入侵了。
第一，在恢复前，必须要在电脑中下载并且安装数据恢复软件，然后将需要恢复的移动硬盘连接到电脑，并且保证被电脑识别。
第二，打开数据恢复软件，选择“硬盘分区丢失/损坏”来实施恢复模式，点击进入移动硬盘，点击下一步进入扫描阶段，扫描后会出现你所丢失的文件，选中要恢复的文件，点击下一步，选择需要恢复的文件，用户可以对文件进行预览，查看是否是自己想要找回的文件，然后点击下一步，这里需要注意，一般来说，文件丢失后，文件名称也会被系统自动更改名称，如果未扫描到需要文件，请使用“万能恢复”模式再次扫描恢复，最后选择恢复文件存放目录，等待恢复完成即可。
第一，如果确认移动硬盘中病毒后，要小心它感染到主机，所以连接电脑以后，不要打开任何的程序，也要对电脑的杀毒软件进行升级，把电脑中的系统还原关闭，防止病毒复活。
第二，做完这些后，要重启电脑，这里需要注意，要按下电脑开机按钮的时候，要一直按动F8，这样电脑才会进入安全模式，在安全模式下，打开电脑的杀毒软件，对电脑以及移动硬盘进行全盘查杀病毒，一般来说，这样查杀过以后，就可以清除掉移动硬盘中的病毒，然后就可以正常浏览文件或者存储文件了。
第三，如果在全盘查杀以后，移动硬盘中还是有病毒，那就只能对移动硬盘进行格式化，然后再重新分区，但是如此一来，就会让里面的文件损失，所以用户在进行格式化以前，一定要先备份好文件，或者先想清楚，里面是否有重要的文件可以损坏。
第一，一般来说，用户购买到的计算机的用户名都是Administrator，而用户要防止移动硬盘中病毒，必须把这个登录名改掉，具体的操作方法是点击“开始”菜单的子菜单“运行”，输入“gpedit.msc”，在弹出的组策略工作台里面的“计算机配置—Windows设置—安全设置—本地策略—安全选项”下找到“重命名系统管理员帐户”把Administrator重命名为你想要的名字。
第二，确认移动硬盘的分区为NTFS格式，在文件夹选项里点击查看选项卡，然后把“使用简单文件共享”的钩去掉，右键点击想要分配权限的分区，选择属性，在弹出的对话框中点击安全选项卡，删除掉里面已经存在的用户或组，只留下Everyone，然后再添加改过名的Administrator，如果用的别的用户名的话就添加你自己使用的那个用户名，然后在下面权限那里给Everyone设置为只读权限，管理员为完全控制，点击应用。