土壤生物污染是指病原体和带病等有害生物种群从外界侵入土壤，破坏土壤生态系统的平衡，引起土壤质量下降的现象。有害生物种群来源是用未经处理的人畜粪便施肥、生活污水、垃圾、医院含有病原体的污水和工业废水(作农田灌溉或作为底泥施肥)，以及病畜尸体处理不当等。通过上述主要途径把含有大量传染性细菌、病毒、虫卵带入土壤，引起植物体各种细菌性病原体病害，进而引起人体患有各种细菌性和病毒性的疾病，威胁人类生存。
生物污染物进入土壤后，伴随有累积、吸附和繁殖等行为的产生。尽管在一个相当长的时间内，大部分污染物仍旧残留于土壤中，但亦有相当一部分可随地表径流而进入附近水域，引起地表水水体污染;亦可随灌溉、淋洗和渗滤进入地下水，造成地下水污染。此外，土壤中积累的污染物可转移至植物或其他生物体内，从而引起食物链污染。
危害一：土壤生物污染会引起植物病害，造成农作物减产。一些植物致病菌污染土壤后能引起茄子、马铃薯和烟草等百余种植物的青枯病，能造成果树细菌性溃疡和根癌。
危害二：某些真菌会引起大白菜、油菜和萝卜等100多种蔬菜烂根，还可导致玉米、小麦和谷子等粮食作物的黑穗病。还有一些线虫可经土壤侵入植物根部并引起线虫病，甚至在土壤中传播植物病毒。
危害三：土壤中的各种病原微生物和寄生虫不仅可以通过食物链进入人体，使人感染发病，还可直接通过皮肤接触由土壤进入人体，危害人体健康。
危害四：被病原体(包括细菌、放线菌、真菌)污染的土壤能传播伤寒、副伤寒、痢疾和病毒性肝炎等疾病。某些寄生虫卵在温暖潮湿的土壤中经过几天孵育出感染性幼虫，然后再通过皮肤接触进入人体，尤其是从伤口进入，从而导致继发性疾病
在土壤环境中，凡是有害于土壤生态环境和人体健康的动物、植物、微生物均被称为土壤生物污染物。土壤生物污染物种类繁多，但对于人体健康来说，以土壤致病微生物和寄生虫最为重要。
土壤致病微生物
土壤微生物的种类很多，有细菌、真菌、放线菌、藻类和原生动物等。土壤微生物的数量也很大，1g土壤中就有几亿到几百亿个。1m2耕作层土壤中，微生物的质量可能就有几千克。土壤越肥沃，微生物越多。绝大多数土壤微生物对人类的生产和生活活动是有益的，且土壤微生物也是地球生物圈物质大循环中的主要成员，主要担负着分解者的任务。土壤致病微生物虽然数量和种类占据少数，但是它们对人类的健康能造成很大危害，所以往往是土壤生物污染关注的焦点。这类生物污染物包括细菌、真菌、病毒、螺旋体等微生物，其中致病细菌和病毒带来的危害较大。
土壤生物污染是指病原体和带病等有害生物种群从外界侵入土壤，破坏土壤生态系统的平衡，引起土壤质量下降的现象。有害生物种群来源是用未经处理的人畜粪便施肥、生活污水、垃圾、医院含有病原体的污水和工业废水(作农田灌溉或作为底泥施肥)，以及病畜尸体处理不当等。
土壤生物污染物的来源
由于人类的生活和生产活动将大量有害废物、污水向土壤表面堆放和倾倒，大气中的有害气体及飘尘也不断随雨水降落在土壤中，这不仅引起土壤化学污染，也引起土壤环境生物污染。
污水灌溉
未经处理的城市生活污水、饲养场和屠宰场废水、医院污水可能携带大量病原微生物和寄生虫卵，灌溉时即可污染土壤及蔬菜。1985年我国某市郊区蔬菜地土壤中，污灌区、清污轮灌区和清灌区每克土中检出大肠菌群数平均值分别为1495个、1495个和1273个；在污灌区、清污轮灌区每克土中检出蠕虫卵分别为4.5个和6.2个，属于强烈污染。