盐碱土形成的根本原因在于水分状况不良，所以在改良初期，重点应放在改善土壤的水分状况上面。一般分几步进行，首先排盐、洗盐、降低土壤盐分含量;再种植耐盐碱的植物，培肥土壤;最后种植作物。具体的治理方法是：
1、洗盐。洗盐就是把水灌到盐碱地里，使土壤盐分溶解，通过下渗把表土层中的可溶性盐碱排到深层土中或淋洗出去，侧渗入排水沟加以排除。
2、平整土地。平整土地可使水分均匀下渗，提高降雨淋盐和灌溉洗盐的效果，防止土壤斑状盐渍化。
3、适时耙地。耙地可疏松表土，截断土壤毛细管水向地表输送盐分，起到防止返盐的作用。耙地要适时，要浅春耕，抢伏耕，早秋耕，耕干不耕湿。
4、增施有机肥，合理施用化肥。
目前，我国盐碱地综合高效改良种植技术模式已经取得了切实有效的成果，重度盐碱土壤经一次性改良后，水稻、高粱、玉米、绿豆、向日葵、甜菜、燕麦、黑麦草、稷子等作物长势良好，产量显著好于传统方法改良并种植的作物。
但是，在多年生产实践中，我们发现，盐碱地生态改良推广工作依旧存在很大的难度。自然原因上，盐碱地大面积分布地区气候环境恶劣，生产基础条件较差，导致农业机械化水平较低。成本原因上，水渠建设、机械购置、土地平整成本高昂，加上改良剂、肥料、水、电、种植材料等，极大地加剧了当地农民盐碱地改良的经济负担。因此，大面积盐碱地改良工作多在企业及种植大户的推动下才得以开展。
事实上，多数国内相关企业由于缺乏国家专项资金扶持、投资较大、资金回收慢、技术不成熟等原因，盐碱地改良项目往往损失惨重，这严重制约了我国盐碱地高效利用工作的开展。建议国家把资金和政策重点放在鼓励盐碱地开发的农民及企业上，减少他们的改良成本，在相关企业技术力量的支持和指导下，充分调动当地农民盐碱地开发的积极性，保障粮食供给，促进农民增收，同时实现精准扶贫。
作为资源来讲，盐碱地治理非常重要。但在盐碱地治理问题上，有损益的问题，一定要算成本。
从农业资源来讲，如何合理利用，关键问题是做好顶层设计。不是可治理的地方就一定要治，土地资源利用、水资源利用是系统工程，例如，治理后水资源配比情况如何，哪些地方成本太高，均需要综合考虑。
对于不同地方，既要综合施策也要分类施策。例如在新疆地区，曾采用脱硫石膏这种化学技术进行治理，原因在于当地脱硫石膏几乎不用钱，本身堆在电厂是废物，100公里运距范围内基本电厂是不收钱的。因此采用这种办法灌水一次，大概十几年就可以治理成功。这样一测算成本，除了个别地方排渠和灌渠需要改造之外，其他成本很低。然而面临的问题是，因为盐碱地很复杂，各地PH值并不一样，对土壤机理的化验是一笔非常大的费用。有时工程设施和其他设施钱用得不多，但是在测土方面会花很多钱，而且这方面的投入是消耗性的。