1．消化系统：本品口服可引起恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道反应。偶有食管炎和食管溃疡的报道，多发生于服药后立即卧床的患者。
2．肝毒性：脂肪肝变性患者和妊娠期妇女容易发生，亦可发生于并无上述情况的患者。偶可发生胰腺炎，本品所致胰腺炎也可与肝毒性同时发生，患者并不伴有原发肝病。
3．过敏反应：多为斑丘疹和红斑，少数病人可有荨麻疹、血管神经性水肿、过敏性紫癜、心包炎以及系统性红斑狼疮皮损加重，表皮剥脱性皮炎并不常见。偶有过敏性休克和哮喘发生。某些用本品的患者日晒可有光敏现象。所以，建议患者服用本品期间不要直接暴露于阳光或紫外线下，一旦皮肤有红斑应立即停药。
4．血液系统：偶可引起溶血性贫血、血小板减少、中性粒细胞减少和嗜酸粒细胞减少。
1.多西环素可作为治疗下列疾病的选用药物:（1）立克次体病，包括流行性斑疹伤寒、地方性斑疹伤寒、恙虫病；（2）肺炎支原体所致感染；（3）衣原体感染，包括鹦鹉热、衣原体淋巴肉芽肿（性病淋巴肉芽肿）、非特异性尿道炎、输卵管炎及沙眼；（4）回归热；（5）布氏菌病（与氨基糖苷类药联用）；（6）霍乱；（7）鼠疫（与氨基糖苷类药联用）；（8）兔热病。
2.多西环素可用于治疗对青霉素类抗生素过敏的破伤风、气性坏疽、雅司病、梅毒、淋病和钩端螺旋体病。
3.多西环素也可用于治疗敏感菌所致的呼吸道、胆道、尿路和皮肤软组织感染。
4.由于无明显肾脏毒性，多西环素也可用于有四环素适应证但合并肾功能损害的感染患者。
5.多西环素还可短期服用作为旅行者腹泻的预防用药。
1.全身免疫功能减退者慎用。如每天应用0.1g不足以维持有效血药浓度。
2.肝肾功能轻度不全者，多西环素的半衰期与正常者无显著差异，但对肝肾功能重度不全者则应注意慎用。
3.多西环素发生二重感染的比例较青霉素高，涉及阴道、咽喉、口腔、肠道等部位，注意二重感染的发生。服药期间不宜暴露在日光下，以防发生皮肤反应。
4.交叉过敏:对一种四环素类药过敏者可能对其他四环素类药过敏。
5、孕妇及哺乳期妇女用药
孕妇静脉注射多西环素的研究还未进行。在无医嘱的情况下，不得给孕妇使用。
动物实验表明，四环素类药物能通过胎盘，在胎儿组织中发现药物，对胎儿的发育有毒性（妨碍骨骼的生长）。在动物怀孕初期用药产生的胚胎毒性已有记载。哺乳期妇女服用该类药物后乳汁中发现药物存在。