形成赤潮的主要原因是海水中红藻等大量迅速地生长所致。
红藻绝大部分海生，见于热带和亚热带海岸附近，常附著于其他植物。叶状体有丝状、分枝状、羽状或片状。细胞间连以纤细的原生质丝。除叶绿素外，尚含藻红素和藻蓝素，故常呈红色或蓝色。红藻的生殖细胞不能运动。雌性器官称果孢，由单核区和受精丝构成。不动精子在精子囊中单生。重要的食用红藻(如紫菜、掌状红皮藻)煮熟后仍保持其色泽及胶体性质。工业上，角叉菜属(Chondrus)红藻作为明胶的代用品用于布丁、牙膏、冰淇淋及保藏食品中。珊瑚藻属(Corallina)的某些种在形成珊瑚礁与珊瑚岛的过程中起重要作用。主要由江蓠属(Gracilaria)和石花菜属(Gelidium)红藻制备的琼脂是细菌和真菌培养基的重要成分。
1998年9月，中国渤海锦州湾海域风和日丽，虽已入秋，夏天的余温却还未从海水中散尽。海面上空，一架“中国海监”的飞机盘旋着，在执行巡航任务。飞机在掠过锦州湾东部海域上空时，飞行员发现有一大片海水在阳光下泛着褐红色，犹如番茄汤一般。这就是赤潮现象。这一大片褐红色的赤潮海域有3000平方公里之大，是自1933年中国首次报道发生赤潮以来面积最大的一次。
2000～2003年，我国东海发生赤潮的次数逐年递增，在2003年之后的两年赤潮发生数有所下降，且基本稳定;2006年和2007年赤潮发生数又有所增加;2007年后才呈现下降趋势。
人类为保护海洋正在做出种种不懈的努力,包括禁止向海洋倾倒工业废料和生活垃圾、生活污水处理之后再排放入海。
研究人员报告说，即便人类到本世纪末能够抑制大气中的二氧化碳含量，大面积耗尽氧气的海洋依然会持续存在几百年乃至几千年的时间。作为全球变暖的一个后果，海洋中的氧气含量降低将威胁全世界大多数海洋生物——包括鱼类、贝类以及人类餐桌上的其他常客——的生存直至22世纪。
赤潮让海洋缺氧的原因：海洋是一种生物与环境、生物与生物之间相互依存，相互制约的复杂生态系统。系统中的物质循环、能量流动都是处于相对稳定，动态平衡的。当赤潮发生时这种平衡遭到干扰和破坏。在植物性赤潮发生初期，由于植物的光合作用，水体会出现高叶绿素a、高溶解氧、高化学耗氧量。这种环境因素的改变，致使一些海洋生物不能正常生长、发育、繁殖，导致一些生物逃避甚至死亡，破坏了原有的生态平衡。
赤潮是一个历史沿用名。如夜光藻、中缢虫等形成的赤潮是红色的，甲藻赤潮则多呈深褐色、红褐色，角毛藻赤潮一般为棕黄色，绿藻赤潮是绿色的。据有关资料表明，夜光藻是海洋赤潮主要发生藻,也是东海赤潮发生的原因种之一。
夜光藻是一种危害很大的有毒赤潮藻类。它主要是分泌神经毒素，毒害鱼虾的呼吸系统或抑制其呼吸，危害鱼虾健康。影响摄食，引发空肠空胃，游塘伏边。夜间，时常发生鱼虾在水面狂游跳塘的现象。有夜光藻的水体一般都会伴有荧光弧菌。如不及时处理会暴发大量偷死，甚至排塘。
夜光藻的防控：
使用保肝促长灵+本草大康拌料内服，每公斤料各拌15克，同时外泼本草大康+活性蒜宝(1+1用1亩)。