随着现代化工、农业生产的迅猛发展，沿海地区人口的增多，大量工农业废水和生活污水排入海洋，其中相当一部分未经处理就直接排入海洋，导致近海、港湾富营养化程度日趋严重。同时，由于沿海开发程度的增高和海水养殖业的扩大，也带来了海洋生态环境和养殖业自身污染问题；海运业的发展导致外来有害赤潮种类的引入；全球气候的变化也导致了赤潮的频繁发生，由此可以看出：赤潮并不是自然灾害，属于是环境问题，例如：水土流失、土壤盐碱化等都不是自然灾害，而是环境问题。
赤潮的危害；
一是大量赤潮生物集聚于鱼类的鳃部，使鱼类因缺氧而窒息死亡；
二是赤潮生物死亡后，藻体在分解过程中大量消耗水中的溶解氧，导致鱼类及其它海洋生物因缺氧死亡，同时还会释放出大量有害气体和毒素，严重污染海洋环境，使海洋的正常生态系统遭到严重的破坏；
赤潮是海洋系统中的生物灾害，因此，是海洋灾害，也是生物灾害。水域中一些浮游生物暴发性繁殖引起的水色异常现象成为赤潮，它主要发生在近海海域。在人类活动的影响下，生物所需的氮、磷等营养物质大量进入海洋，引起藻类及其他浮游生物迅速繁殖，大量消耗水体中的溶解氧量，造成水质恶化、鱼类及其他生物大量死亡的富营养化现象，这是引起赤潮的根本原因。由于海洋环境污染日趋严重，赤潮发生的次数也随之逐年增加。
香港海域曾经就发生了历史上最严重的一次赤潮。由于赤潮的频繁出现，使海区的生态系统遭到严重破坏，赤潮生物在生长繁殖的代谢过程和死亡的赤潮生物被微生物分解等过程中，消耗了海水中的氧气，鱼、贝因窒息而死。另外，赤潮生物的死亡，促使细菌大量繁殖，有些细菌能产生有毒物质，一些赤潮生物体内及其代谢产物也会含有生物毒素，引起鱼、贝中毒病变或死亡。
赤潮是在特定的环境条件下，海水中某些浮游植物、原生动物或细菌爆发性增殖或高度聚集而引起水体变色的一种有害生态现象。赤潮是一个历史沿用名，它并不一定都是红色，实际上是许多赤潮的统称。赤潮发生的原因、种类、和数量的不同，水体会呈现不同的颜色，有红颜色或砖红颜色、绿色、黄色、棕色等。值得指出的是，某些赤潮生物(如膝沟藻、裸甲藻、梨甲藻等)引起赤潮有时并不引起海水呈现任何特别的颜色。
人为因素：
赤潮形成的原因主要是该海域排入大量工农业污水和生活污水，导致海水服营养化。
自然因素：
由于20—30℃是赤潮发生的适宜温度范围，所以水温气象也是赤潮发生的因素之一。
与纬度位置、季节、洋流、海域的封闭程度等自然因素有关。