水库水华的特征以三峡库区来详细的讲解。
三峡库区支流富营养化普查结果显示，三峡库区支流水体总体上处于中—富营养水平，局部水域部分时段富营养化水平较高。其中水库蓄水所形成的缓流态是水华发生的直接诱因，而水温、枯水季节低水位则对水华发生时段和表现类型等有一定影响。尽管长江干流部分江段氮、磷含量水平较高，但因其水量充沛、流速较急、水体浑浊度较高的特点，尚不充分具备富营养化发生条件。无论蓄水前、后，在长江干流和支流绿藻和硅藻始终是构成藻类的主要类群。
从2003年6月三峡水库135m蓄水起，库区的部分支流局部河段与库湾每年均有程度不同的水华发生，并呈现如下特点：
1、水华发生的敏感区段随着蓄水位的抬升，向支流的上游河段推进，每次蓄水的新增回水河段是水华发生的最敏感区。
水华束丝藻分布广泛，淡水水域。
水华束丝藻形态特征
藻丝直或稍弯曲，单一或藻丝侧面相连成束状群体。藻丝中部细胞短柱形，多少呈方形。具假空泡。末端细胞多少变得尖细，延长成无色细胞。胶鞘模糊不清。异形胞间生，各种形状，圆柱形、近球形、椭圆形。
水华束丝藻生长环境
营浮游生活。可大量繁殖，形成水华。
繁殖习性 厚壁孢子圆柱形，或宽椭圆形，原离异形胞。
以长江地区的湖泊水华现象来进行说明，长江流域水体富营养化导致水华现象明显。
长江流域湖泊众多，绝大多数分布于长江中下游区，属浅水型湖泊。20世纪末对流域内31个湖泊的抽样调查结果表明，18个湖泊处于中营养状态，占58%;13个湖泊处于富营养状态，占42%，主要为城市(郊)湖泊，如云南滇池、武汉东湖、上海淀山湖等。“四大”淡水湖泊中，鄱阳湖和洞庭湖现在基本处于中营养状态，局部水域的营养状态在不断升高;巢湖和太湖则已经达到了富营养状态。虽然长江流域多数湖泊处于中营养水平，但存在向富营养湖泊转化的趋势。
水华是淡水水体中藻类大量繁殖的一种自然生态现象，是水体富营养化(可用养分增加导致藻类过度生长)的显著特征。富营养化可能会在湖泊中自然发生，但其主要原因仍是生活及工农业生产中含有大量氮、磷的污水进入水体后，造成蓝藻、绿藻、硅藻等大量繁殖，其中蓝藻水华的发生范围最广，且危害最大，对人类健康威胁不容忽视。目前，人为向水体排放营养物已经使全球范围内的富营养化现象明显加重，导致水质下降、鱼类灭绝和生物多样性减少。
我国池塘养鱼以肥水、密养、混养为特点，由于水中溶解有机质和营养盐类十分丰富，浮游植物量很高，水色浓，有时还出现藻团、浮膜等，也就是说经常出现水华。通过对全国各地常见水华的调查和统计，按优势种类可以分为l5个基本类型。
隐藻水华这是我国池塘养鱼常见的一种水华，其出现频率在各地肥水中可达到80% 一100% ，次优势种常称为小环藻、蓝隐藻和绿球藻的一些种类。水色褐、红褐、褐绿和褐青。全年都可出现。
膝口藻水华在无锡地区的鱼池中，是夏季肥水后最常见的水华，在生长期中出现的频率近60% 。优势种为扁型膝口藻，次优势种为隐藻和裸甲藻，有时绿球藻类也较多，水色褐青或褐绿。
裸甲藻水华这是由蓝绿甲藻大量繁殖引起的，在江浙和广东肥水中较常见，夏秋季出现较多。夏季长与扁型膝口藻共存。水色褐绿，褐青或铁灰，水面长有云雾状蓝绿色斑团，渔农称为“转水”。