土豆贮藏期病害病原不同，类别不一，发病的症状特点也不一致。普遍发生的病害主要有6种，依次为干腐病、晚疫病、湿腐病、坏疽病、环腐病、软腐病。其中晚疫病在贮藏中前期表现极为明显，干腐病在贮藏中后期表现较为突出，这两种病害是马铃薯贮藏期间的主要病害。
1、干腐病：真菌性病害，开始时薯块表皮局部颜色发暗、变褐色，以后病部略微凹陷，逐渐形成褶叠，呈同心环纹状皱缩，其上有时长出灰白色的绒状颗粒;后期薯块内部变褐色，常呈空心，空腔内长满菌丝;最后薯肉变为灰褐色或深褐色，僵缩、干腐，变轻、变硬。
2、晚疫病：真菌性病害，块茎染病初生褐色或紫褐色大块病斑，稍微凹陷，病部皮下薯肉亦呈褐色，慢慢向四面扩大或烂掉。
3、软腐病：细菌性病害，块茎染病多由皮层伤口引起，发病初期薯块皮孔受侵染后表面出现轻微凹陷的病斑，淡褐色至褐色，病斑呈圆形水渍状，很快颜色变深、变暗，薯块内部逐渐软腐;条件适宜时，病薯很快腐烂，发出恶臭;干燥后薯块呈灰白色粉渣状。
早疫病
主要发生在叶片上，也可侵染块茎。叶片染病病斑黑褐色，圆形或近圆形，具同心轮纹，大小3-4mm。湿度大时，病斑上生出黑色霉层，即病原菌分生孢子梗和分生孢子。发病严重的叶片干枯脱落，田间一片枯黄。块茎染病产生暗褐色稍凹陷圆形或近圆形病斑，边缘分明，皮下呈浅褐色海绵状干腐。该病近年呈上升趋势，其为害有的地区不亚于晚疫病。
晚疫病
马铃薯的各个部位均可发生晚疫病,但最明显的部位是叶和块茎上的病斑。叶上大多从叶尖或叶缘开始,先发生不规则的水浸状绿褐色斑点,病斑周围具浅绿色晕圈,随着病斑的扩大愈合而变成暗褐色,湿度大时病斑扩大迅速,有时在叶背健康与患病部位的交界处出现一层白色霉层。干燥时病斑变褐干枯,质脆易裂,不见白霉。发现严重时导致全株黑腐,全田一片枯焦。
土豆叶片病害一：晚疫病
危害表现：受害叶片的叶尖、叶缘会出现暗绿色小病斑，边缘有灰绿色晕环，边缘分界不明显。湿度大时，外缘会出现一圈白霉。天气干燥时，病部会变褐干枯，质脆易裂。病害严重时，病斑扩展到叶脉、叶柄和茎部，病叶枯死脱落。
土豆叶片病害二：早疫病
危害表现：病害可发生在叶片上，也可侵染块茎。叶片染病，病斑黑褐色，圆形或近圆形，具同心轮纹。湿度大时，病斑上生出黑色霉层病征。
土豆叶片病害三：炭疽病
危害症状：主要危害叶片。在叶片上形成近圆形或不定形的赤褐色至褐色坏死斑，后转变为灰褐色，边缘明显，相互汇合形成大的坏死斑。
土豆叶片病害四：软腐病
危害表现：主要危害叶、茎及块茎。叶染病近地面老叶先发病，病部呈不规则暗褐色病斑，湿度大时腐烂。
土豆种植容易，想要管理却并不轻松，而根须发黑的现象，便是根腐病的前兆，也就是很多根系作物在种植过程中的“克星”型病害。一般来说，当土豆出现烂根之后，随即而来的便是一系列连锁反应，其中最为严重的，就是由于这种疾病能过通过土壤进行扩散，所以往往少数感染会形成面积感染，而部分受灾就会转向整体受灾的层面。因此，根腐病如果不能够及时发现并防治，对于种植户而言绝对是一个严重的打击。
土豆须根病害防治方法
防治一：合理轮作，及时清除清理土壤表面病残体，施用充分腐熟农家肥，深耕，精细整地，采用高畦覆膜栽培。严禁大水漫灌，避免雨后田间积水。注意防治地下害虫。浇水后及时松土，增强土壤透气性。
防治二：建立无病留种田，精选无病块根做种薯，增施有机肥料与钾肥，加强田间管理，及时喷洒药剂，提高植株自身的抗病性能。
1、种子处理
清除种子带菌及虫源，主要有：干腐病、枯萎病、早晚疫病、蚜虫、蛴螬、金针虫、地老虎。
防治方法：用拌趣1+1各20克兑水1250-1500毫升喷种块100公斤。
2、土壤处理
用生物菌调理土壤，减少病虫害发生，提高产量。
施肥方法：亩用底肥超能量100-125公斤加硫酸钾(15-15-15)125-150公斤，病害严重的加冲施可乐生物菌10-25公斤，或蚓力神菌液2-3公斤，每亩2袋绿亨毒辛拌土撒施。
3、播种
适时播种，掌握播种深度是提高产量的关键。
播种方法：3月上旬播种，垄高15厘米左右，垄宽75厘米，双行定植，行距30厘米，株距25厘米，粘土播深8厘米，沙土播深12厘米，播后覆土档平后喷除草剂。
据专家介绍土豆黑痣病又称“黑色粗皮病、茎溃疡病”，是重要的土传真菌性病害。主要表现为在马铃薯表皮上形成黑色或暗褐色的斑块，即黑痣病菌核。
土豆黑痣病病原
立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)，属半知菌亚门真菌。菌核初白色，后变为褐色，大小0.5～5毫米。最低生长温度为4℃，最适为23℃，最高为32～33℃，34℃时停止生长。菌核形成的最适温度23～28℃。分枝处大多有缢缩，并在附近生有一隔膜，新分枝菌丝逐渐变为褐色，变粗短后纠结成菌核。
土豆黑痣病危害症状
黑痣病可危害马铃薯的幼芽、茎基部及块茎。芽块播种到田里出芽后，幼芽顶部出现褐色病斑，使生长点坏死，不再继续生长。因输导组织受阻，其叶片则逐渐枯黄卷曲，植株易倒死亡，此时常在土表部位再生气根，产出黄豆大的气生块茎。地下块茎发病多以芽眼为中心，生成褐色病斑，影响出苗率，造成苗不全、不齐、细弱等现象。
1.马铃薯晚疫病
植株被晚疫病侵袭时，首先在叶尖或叶缘出现病斑，病斑外围有黄绿色症状，潮湿时迅速扩大，腐败发黑，病斑边缘不清，出现特殊的腐败气味，叶边缘出现一圈白色霉状物，在叶子背面长有白霉，形成霉轮(诊断可采用保湿培养法，将病叶置于培养皿或碗内湿沙上保湿一夜，第二天如果病斑边缘产生白霉就是晚疫病，如果出现黑色霉层则是早疫病。晚疫病多发生在开花后)。天气干燥时，病斑干枯呈褐色，叶背无白霉。茎部受害，初呈稍凹陷的黑色条斑，潮湿时表面则产生白色霉层。块茎发病时表皮变褐色不规则斑点，稍凹陷，组织变硬，切开后内部薯肉呈锈褐色。一旦转入块茎，块茎立即腐烂。
防治措施:
(1)选用抗病品种。
(2)选用无病种薯。留种块茎在入窖前和出窖后进行催芽前严格挑选，剔除有病块茎。经催芽后凡不发芽或发芽慢，出现病症的全部剔除;切块播种或整薯播种时严格检查，剔除病薯烂薯。